پس از برکناری وزیر علوم توسط نمایندگان مجلس،حسن روحانی در احکام جداگانه ای دکتر محمد علی نجفی را به عنوان سرپرست وزارت علوم و دکتر فرجیدانا را به عنوان مشاور رئیس جمهور در امور علمی و آموزشی منصوب کردند. حکم روحانی برای فرجی دانا: بسمالله الرحمن الرحیم جناب آقای دکتر رضا فرجی دانا توفیق همکاری با دانشمندی پرتلاش چون جنابعالی برای دولت تدبیر و امید فرصت ارزشمندی بود که بسیار علاقمند بودم این همکاری همچنان ادامه مییافت. اینک، ضمن آرزوی توفیق برای ادامه خدمت به نظام مقدس جمهوری اسلامی، مراتب تقدیر و تشکر خود را از زحمات و تلاشهای بیدریغ و ارزنده جنابعالی در طول دوره مسئولیت در وزارت علوم، تحقیقات و فناوری ابراز میدارم. امید است همچون گذشته با اتکاء به ایمان، دانش و تجربیات ارزشمندتان همواره منشأ خدمات مؤثری برای کشور باشید و با عنایات الهی در جهت تحقق آرمانهای انقلاب اسلامی و اهداف نظام مقدس جمهوری اسلامی ایران موفق باشید. بدینوسیله جنابعالی را به عنوان مشاور رییس جمهور در امور علمی و آموزشی منصوب مینمایم تا همچنان در کنار دولت تدبیر و امید منشأ خدمات ذیقیمتی باشید. حسن روحانی حکم روحانی برای نجفی: بسمالله الرحمن الرحیم جناب آقای دکتر محمدعلی نجفی با تشکر فراوان از زحمات جناب آقای دکتر فرجی دانا در دوران مسئولیتشان به عنوان وزیر علوم، تحقیقات و فناوری، براساس اصل ۱۳۵ قانون اساسی و نظر به مراتب تعهد و سوابق علمی و مدیریتی جنابعالی به موجب این حکم، شما را به سرپرستی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری برمیگزینم. امید است با توفیقات الهی و تلاش همه همکاران آن وزارت، اعضای هیأتهای علمی و دانشجویان دانشگاهها و مراکز تحقیقاتی سراسر کشور، در خدمت به ملت شریف ایران و نظام جمهوری اسلامی با رعایت اصول قانونمداری، اعتدالگرایی و منشور اخلاقی دولت تدبیر و امید موفق باشید.
رییس جمهور در حکمی محمدعلی نجفی را به عنوان سرپرست وزرات علوم منصوب کرد.